一、計時工資是不是還存有加班工資

計件工資制僅僅薪水酬勞測算的一種方法，它并無法更改法律法規對上班時間的標準規定。

在我國《勞動法》第三十六條要求，國家實行員工每日上班時間不超過8鐘頭、均值每星期上班時間不超過44鐘頭的工時制度。與此同時，該法第三十七條要求，對推行記件工作中的員工，用人公司理應依據此方法第三十六條要求的工時制度有效明確其勞動定額和記件酬勞規范。

根據前文的詳細介紹，你應該可以看得出，超出44鐘頭的工作均應歸屬于加班加點，用人公司理應付款員工加班費。

二、加班工資難題能否申請支付令

用人公司托欠或是未全額付款勞務報酬的，員工可以依規向本地人民檢察院申請支付令。托欠加班工資，可以申請支付令。支付令是人民檢察院按照《民事訴訟法》要求的督促程序，依據債務人的申請辦理，向借款人傳出的期限執行計付錢財或商業票據的裁判文書。

難題是依據《民事訴訟法》第一百九十一條，申請支付令務必滿足一定的標準，債務、債務關系務必清晰。債務人與當事人沒有別的經濟糾紛，申請報告需要注明要求計付錢財或是商業票據的數目和所依據的客觀事實、直接證據。

最高法院《關于審理勞動爭議案件適用法律若干問題的解釋(二)》第三條也曾作過這種的要求：員工以公司的工資欠條為直接證據可以向法院提起訴訟，訴請不涉及到勞務關系別的問題的，視作托欠勞務報酬異議，依照一般民事經濟糾紛審理。

2010年7月12日由最高法院審理聯合會第1489次大會根據，自2010年9月14日起實施的《最高人民法院關于審理勞動爭議案件適用法律若干問題的解釋(三)》第十七條從此做出了更為清晰的要求：員工根據《勞動合同法》第三十條第二款和調解仲裁法第十六條要求向人民檢察院申請支付令，合乎民訴法第十七章督促程序要求的，人民檢察院予以審理。

根據《勞動合同法》第三十條第二款要求，申請支付令被人民檢察院判決結束督促程序后，員工就關于勞動仲裁事宜立即向法院提起訴訟的，人民檢察院理應通知其先向勞動人事異議監察委員會申請勞動仲裁。如今劉先生和老板就加班工資的情況還存有異議，其與工人的加班工資沒有獲得商家的認同，手上沒有他從此給出的借條。此糾紛案件都還沒轉換為債務糾紛案件，從此不可以申請支付令，而應申請辦理勞動仲裁，根據勞動仲裁處理此關于勞動仲裁難題。

員工在運行前，應積極主動的依照法律法規和這種用人公司簽署勞動合同書，對自己的工作利益開展維護。在勞動合同書中，應積極主動的對這種工作時間開展注明。一旦產生勞務糾紛時，有關的員工可以依照勞動合同書維護保養自己的工作利益。